Utilización de marcadores moleculares para el estudio de hongos basidiomicetes silvestres
DOI:
https://doi.org/10.35197/rx.08.03.e1.2012.14.bgPalabras clave:
Hongos, RFLP, SouthernResumen
Las técnicas de marcadores moleculares en el estudio de basidiomicetos silvestres, son cada vez más aplicadas a proyectos de ecología, con especial enfoque en análisis de la diversidad genética. Con frecuencia se requieren métodos especializados para la extracción del DNA de organismos de ambientes naturales, debido a los complejos compuestos que los constituyen (polímeros de carbohidratos) y los contaminantes del ambiente (partículas de suelo). Los materiales biológicos utilizados fueron basidiocarpos colectados en el bosque de Santa Rosa, Gto., y micelio aislado de estos basidiocarpos. En este trabajo se utilizó un método de extracción de DNA que permitió la amplificación por PCR, digestión con enzimas de restricción y la hibridación Southern por método no radiactivo. Los resultados que se obtuvieron: La amplificación de la región ITS1 de la unidad ribosomal de las diferentes especies de basidiomicetos. Se logró observar la diversidad genética entre las diferentes especies de basidiomicetos y los micelios. Además los resultados también sugieren diferencias en metilación del DNA entre el micelio vegetativo y el micelio del basidiocarpo. Por último cabe mencionar que no se encontraron trabajos previos sobre la aplicación de métodos de hibridación Southern no radiactivos para el análisis de basidiomicetos silvestres, siendo este trabajo pionero en aplicar esta técnica.
Descargas
Citas
Antequera, F.; Tamame M.; Villanueva J. R. y Santos T. 1984. DNA Methylation in the Fungi. The Journal of Biological Chemistry. 259 (13): 8033-8036.
Armstrong, J. L.; Fowles, N. L. y Rygiewicz, P. T. 1989. Restriction length polymorphisms distinguish ectomycorrhizal fungi. Plant and Soil. 116: 1-7.
Atamas, S. P. y White, B. 1997. Nonradioactive method for quantitation of PCR products without hybridization with a specific probe. BioTechniques. 22: 20- 22.
Binz, T.; D’Mello, N. y Horgen, P. A. 1998. A comparison of DNA methylation levels in selected isolates of higher fungi. Mycologia. 90 (5):785-790.
Doerfler, W. 1983. DNA Methylation and Gene Activity. Ann. Rev. Biochem. 52: 93-124.
Erland, S. 1995. Abundance of Tylospora fibrillosa ectomycorrhizas in a South Swedish spruce forest measured by RFLP analysis of PCR-amplified rDNA ITS region. Mycol. Res. 99(12): 1425-1428.
Herrera T. y Ulloa M. 1998. El Reino de los Hongos. Universidad Nacional Autónoma de México. Fondo de Cultura Económica. México. pp. 364 – 433.
Hopple, J. S. Jr. y Vilgalys, R. 1994. Phylogenetic relationships among coprinoid taxa and allies based on data from restriction site mapping of nuclear rDNA. Mycologia. 86(1): 96-107.
Iracabal, B.; Zervakis, G. y Labarére, J. 1995. Molecular systematics of the genus Pleurotus: analysis of restriction polymorphisms in ribosomal DNA. Microbiology. 141:1479-1490.
Jin , T. y Horgen, P. A. 1992. Further characterization of a large inverted repeat in the mitochondrial genomes of Agaricus bisporus (A. brunnescens) and related species. Curr. Genet. 23: 228-233.
Marvik, O. J.; Isaksen, M. L.; Roza, L. y Lindqvist, B. H. 1997. Photoimmunodetection: a nonradioactive labeling and detection method for DNA. BioTechniques. 23: 892-896.
Methven, A.; Hughes, K. W. y Petersen, R. H. 2000. Flammulina RFLP patterns identify species and show biogeographical patterns within species. Mycologia. 92(6): 1064-1070.
Perkins, D. D.; Metzenberg, R. L.; Raju, N. B.; Selker, E. U. y Barry, E. G. 1986. Reversal of a Neurospora crassa translocation by crosing over involving displayed rDNA, and methylation of the rDNA segments that result from recombination. Genetics. 114: 791- 817.
Rogers, S. O.; Rehner S.; Bledsoe, C.; Mueller, G. J. y Ammirati, J. F. 1989. Extraction of DNA from Basidiomycetes for ribosomal DNA hybridizations. Can. J. Bot. 67: 1235-1243.
Rosewich, U. L. y McDonald, B. A. 1994. DNA fingerprinting in Fungi. Methods in Molecular and Cellular Biology. 5:41-48.
Sonnenberg , A. S. M. y Zandt-Linders, J. W. C. 1992. The use of a nonradioactive nucleic acid detection system in the breeding of mushrooms. Focus. 14: 62- 64.
Specht, C. A., Novotny, C. P. y Ullrich, R. C. 1982. Strain specific differences in ribosomal DNA from the fungus Schizophyllum commune. Curr. Genet. 8: 219-222.
Stein, U.; Walther, W.; Wendt, J. y Scild, T. A. 1997. In situ RT-PCR using fluorescence –labeled primers. BioTechniques. 23: 194-198.
Stummer, B. E.; Zanker, T.; Scott, E. S. y Whisson, D. L. 2000. Genetic diversity in populations of
Uncinula necator: comparison of RFLP- and PCR-based approaches. Mycol. Res. 104(1): 44-52. Viaud, M., Pasquier, A. y Brygoo, Y. 2000. Diversity of soil fungi studied by PCR-RFLP of ITS. Mycol.
Res. 104(9): 1027-1032.
White, T. J.; Bruns, T.; Lee, S. y Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. PCR protocols: A guide to methods and applications. M. A. Inns, D.
H. Gelfand, J. J. Sninsky and T. J. White (Eds). Academic Press. San Diego California. USA. 315-322. Wilke, N. W. y Wach, M. P. 1993. Detection of Methylated Mushroom DNA by Restriction Enzyme
Analysis. Mycologia. 85(4): 585-591.
Zolan, M. E. y Pukkila, P. J. 1986. Inheritance of DNA Methylation in Coprinus cinereus. Molecular and Cellular Biology. Jan:195-200.
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Derechos de autor 2012 Blanca Estela Gómez Luna, Gerardo Vázquez Marrufo, Carlos Hernán Herrera Méndez, Alejandro Hernández Morales, Víctor Olalde Portugal
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial 4.0.
Usted es libre de:
- Compartir — copiar y redistribuir el material en cualquier medio o formato
- Adaptar — remezclar, transformar y construir a partir del material
- La licenciante no puede revocar estas libertades en tanto usted siga los términos de la licencia
Bajo los siguientes términos:
- Atribución — Usted debe dar crédito de manera adecuada , brindar un enlace a la licencia, e indicar si se han realizado cambios . Puede hacerlo en cualquier forma razonable, pero no de forma tal que sugiera que usted o su uso tienen el apoyo de la licenciante.
- NoComercial — Usted no puede hacer uso del material con propósitos comerciales .
- No hay restricciones adicionales — No puede aplicar términos legales ni medidas tecnológicas que restrinjan legalmente a otras a hacer cualquier uso permitido por la licencia.